纳豆富含优质蛋白、维生素K2、纳豆激酶、膳食纤维、异黄酮等营养成分，具有促进消化、改善心血管健康、调节骨代谢等作用。
纳豆含有丰富的植物性优质蛋白，其氨基酸组成接近人体需求，消化吸收率较高。蛋白质是构成人体细胞和组织的重要成分，参与免疫调节、酶合成等生理功能。纳豆中的蛋白质经过发酵后更易被人体利用，适合素食者补充蛋白质。
纳豆是天然维生素K2的主要食物来源之一，维生素K2有助于钙质在骨骼中的沉积，对预防骨质疏松具有积极作用。维生素K2还能抑制血管钙化，维护心血管健康。发酵过程中产生的维生素K2生物利用度较高。
纳豆激酶类物质具有溶解纤维蛋白的作用，有助于改善血液循环，降低血栓形成风险。这种活性成分可能对预防动脉粥样硬化有一定帮助。纳豆激酶的活性会随着储存时间延长逐渐降低。
纳豆含有水溶性和不溶性膳食纤维，能促进肠道蠕动，改善便秘情况。膳食纤维还可作为益生元促进肠道有益菌群增殖，维护肠道微生态平衡。适量食用有助于控制餐后血糖上升速度。
大豆发酵过程中产生的异黄酮类物质具有类似雌激素的作用，可能对缓解更年期症状有一定帮助。异黄酮还具有抗氧化特性，能清除体内自由基。纳豆中的异黄酮以小分子形式存在，生物利用度较高。
纳豆作为发酵食品，建议每日食用量控制在50-100克为宜，避免过量摄入引起胃肠不适。初次食用者可从小剂量开始逐步适应其特殊风味和口感。纳豆不宜与抗凝血药物同时大量食用，特殊体质人群食用前应咨询专业医师意见。保存时需冷藏并尽快食用以保证活性成分功效。
