菊花茶具有清热解毒、平肝明目、抗菌消炎、辅助降压等功效，主要作用包括缓解风热感冒、改善眼部疲劳、抑制细菌生长、调节血压水平。
菊花茶性微寒，含有菊苷、黄酮类物质，可缓解风热感冒引起的咽喉肿痛。风热感冒患者可遵医嘱使用银翘解毒片、桑菊感冒颗粒、板蓝根颗粒等药物。
菊花茶中的维生素A前体物质有助于缓解视疲劳，适合长期用眼人群。伴随眼干涩时可遵医嘱使用珍珠明目滴眼液、七叶洋地黄双苷滴眼液、玻璃酸钠滴眼液。
菊花提取物对金黄色葡萄球菌等常见致病菌有抑制作用，可用于轻度皮肤炎症辅助护理。皮肤感染需配合莫匹罗星软膏、红霉素软膏、夫西地酸乳膏等药物治疗。
菊花茶中钾离子和芹菜素有助于血管舒张，可作为高血压患者的辅助饮品。高血压患者应规范服用硝苯地平、氨氯地平、缬沙坦等降压药物。
饮用菊花茶建议每日不超过800毫升，体质虚寒者应搭配枸杞饮用，出现过敏症状需立即停用并就医。
