查幽门螺杆菌可挂消化内科、感染科、胃肠外科或全科医学科，主要与消化系统症状、医院分科设置、合并症及地区就医习惯有关。
多数医院由消化内科负责幽门螺杆菌检测，常规使用碳13或碳14呼气试验，伴随反酸、腹胀等症状时可优先选择。
部分医院将幽门螺杆菌归入消化道感染范畴，若出现腹泻、发热等感染体征可考虑就诊，需排查是否合并其他病原体感染。
当疑似存在胃溃疡穿孔、消化道出血等手术指征时需转诊，常见于长期未治疗导致胃黏膜严重损伤的患者。
基层医疗机构或体检中心多由全科医生开具检测单，适合无症状筛查者或首诊患者进行初步分诊。
检测前需空腹4小时以上，避免服用抗菌药物及抑酸剂，阳性结果需遵医嘱规范治疗并复查。
