制吴茱萸具有温中散寒、疏肝止痛、止呕降逆、助阳止泻等功效，主要用于治疗厥阴头痛、寒疝腹痛、呕吐吞酸、五更泄泻等症状。
制吴茱萸能温煦中焦，驱散脾胃寒邪，缓解因寒邪内盛导致的脘腹冷痛、四肢不温。寒性胃痛患者可配合干姜、高良姜等药物使用，常见制剂有附子理中丸、吴茱萸汤。
本品能疏解肝经郁滞，改善肝气犯胃引起的胁肋胀痛、嗳气频作。常与柴胡、香附配伍，典型方剂包括柴胡疏肝散、四逆散。用药期间应忌食生冷油腻食物。
对于胃寒或肝火犯胃导致的呕吐酸水、呃逆不止，制吴茱萸能有效和胃止呕。临床常配伍黄连制成左金丸，或与半夏、生姜同用，组成吴茱萸汤等复方制剂。
通过温补脾肾阳气，可治疗肾阳不足引发的五更泄泻。多与补骨脂、肉豆蔻等组成四神丸，或配伍五味子、罂粟壳等收敛固涩药物协同增效。
使用制吴茱萸需严格遵医嘱，阴虚火旺者禁用，服药期间避免辛辣刺激饮食，出现口干咽痛等不良反应应及时停用并就医。
