肥胖与内分泌有密切关系，内分泌系统异常是导致肥胖的主要原因之一，常见原因有甲状腺功能减退、多囊卵巢综合征、皮质醇增多症、下丘脑功能紊乱等。
甲状腺激素分泌不足会导致代谢率下降，脂肪分解减少，表现为体重增加、乏力怕冷。治疗需补充左甲状腺素钠片，药物包括优甲乐、雷替斯、加衡。
胰岛素抵抗与高雄激素共同作用导致腹型肥胖，伴随月经紊乱、多毛等症状。治疗可使用二甲双胍改善胰岛素抵抗，药物包括格华止、美迪康、捷诺达。
肾上腺皮质激素分泌过多引发向心性肥胖，出现满月脸、水牛背特征。治疗需使用皮质醇合成抑制剂，药物包括美替拉酮、酮康唑、米托坦。
下丘脑损伤导致瘦素抵抗和食欲亢进，伴随体温调节障碍。治疗需用中枢食欲抑制剂，药物包括盐酸芬特明、利拉鲁肽、司美格鲁肽。
建议肥胖患者定期监测血糖、甲状腺功能和性激素水平，日常保持低升糖指数饮食与抗阻运动，内分泌异常引起的肥胖需在医生指导下进行药物干预。
