新生儿出生时呛羊水，不一定都出现后遗症。是否有问题取决于窒息量、羊水的性质、新生儿当时是否有症状以及症状的严重程度。
羊水清，呛入量少，最多呼吸变快，其恢复快，无后遗症。羊水过多，但窒息量大，称为大量羊水吸入。患儿呼吸加快甚至出现窘迫，必要时需要吸氧和抗感染治疗。
羊水受到污染，特别是严重污染，甚至羊水胎粪污染，病情可能更严重，最严重的胎粪吸入综合征有许多并发症，如新生儿持续性肺动脉高压。如果缺氧严重且持续时间较长，新生儿缺氧缺血性脑病，尤其是重度缺氧缺血性脑病，可能会有后遗症，如脑瘫、神经发育落后等。
