室间隔缺损三毫米一般不严重，属于小型缺损，多数情况下可能自行闭合或长期稳定。若伴随肺动脉高压、反复感染等症状则需警惕病情进展。
小型室间隔缺损在婴幼儿中较为常见，缺损直径小于五毫米时心脏血流动力学影响较小。患儿可能无明显症状，仅在体检时发现心脏杂音。部分病例随着生长发育，缺损边缘组织增生可逐渐闭合，闭合过程可能持续至学龄前。未闭合的小型缺损若未引起并发症，通常无须特殊治疗，但需定期随访心脏超声评估缺损变化及心功能状态。
当缺损导致左向右分流量增加时，可能引发活动耐力下降、生长发育迟缓或呼吸道感染频率增高。肺动脉压力持续升高可能逐步发展为艾森曼格综合征，此时可出现紫绀、杵状指等右向左分流表现。合并感染性心内膜炎风险虽低但仍存在，需在牙科手术等有创操作前预防性使用抗生素。
建议每6-12个月复查心脏超声，观察缺损变化与肺动脉压力情况。日常避免剧烈运动加重心脏负荷，注意预防呼吸道感染。若出现口唇青紫、体力明显下降或体重增长缓慢应及时就医。母乳喂养的婴儿可适当增加喂养频次保证营养摄入，促进生长发育。
