牙齿矫正通常存在一定副作用，但多数可控且可逆。常见副作用主要有牙根吸收、牙周组织损伤、牙齿松动、颞下颌关节不适、口腔溃疡等。规范操作和定期复诊可最大限度降低风险。
牙根吸收是正畸治疗中较难避免的生理性改变，轻微吸收通常不影响牙齿功能。固定矫治器可能刺激牙龈导致红肿出血，通过加强口腔清洁可改善。牙齿移动过程中出现轻度松动属正常现象，矫治结束后会逐渐稳固。部分患者可能因咬合调整出现短暂关节弹响，一般3-6个月可自行缓解。矫治器摩擦黏膜引发的溃疡，使用正畸保护蜡能有效预防。
严重并发症如牙髓坏死、严重牙根吸收等发生率较低，多与个体差异或操作不当相关。骨性错颌畸形患者可能出现治疗后面型改变，需术前充分评估。生长发育期儿童过度干预可能影响颌骨发育，需严格把握适应证。特殊体质患者可能出现对矫治材料的过敏反应，需提前进行过敏测试。
建议选择正规医疗机构进行矫正，治疗期间保持每日3次巴氏刷牙法清洁，使用冲牙器和牙缝刷辅助清洁。避免啃咬硬物防止托槽脱落，定期复查及时调整矫治力度。出现持续疼痛或异常松动应及时就诊，矫治结束后需严格佩戴保持器防止复发。
