黑芝麻买回来后一般需要清洗，可以去除表面灰尘和杂质。若为预包装洁净产品且标注免洗，可直接食用。
散装黑芝麻在采收、运输、储存过程中可能沾染灰尘、泥沙或微生物，清洗能有效降低食品安全风险。清洗时建议使用细网筛流水轻柔冲洗，避免用力搓揉导致营养流失。清洗后需彻底晾干或低温烘干，防止潮湿发霉。未清洗的黑芝麻直接食用可能引起胃肠不适，尤其对免疫力较弱人群风险更高。
部分预包装黑芝麻经过工厂化除尘、色选、灭菌等工序，包装明确标注免洗字样时可直接使用。这类产品通常经过金属检测和微生物控制，安全性有保障。但若发现包装破损或芝麻结块，仍需谨慎处理。
日常储存建议选择密封容器置于阴凉干燥处，避免高温潮湿环境。黑芝麻含丰富不饱和脂肪酸，开封后最好在1-2个月内用完。搭配其他谷物制作芝麻糊或烘焙食品时，根据加工方式决定是否需提前焙炒，高温加热本身也具有杀菌作用。
