先天性心脏缺损的严重程度需根据缺损类型和个体情况判断，部分患者症状轻微，部分可能危及生命。
小型室间隔缺损或卵圆孔未闭等简单缺损可能无明显症状，部分患儿在成长过程中缺损可能自然闭合。这类患者通常仅需定期随访，日常注意预防呼吸道感染，避免剧烈运动。多数情况下不影响正常生活质量和预期寿命，但需警惕心内膜炎等并发症。
大型室间隔缺损、法洛四联症等复杂缺损可能导致严重缺氧、心力衰竭。患儿常出现喂养困难、发育迟缓、紫绀等症状，需在婴幼儿期接受介入封堵或外科矫治手术。未经治疗的重度缺损可能引发肺动脉高压、艾森曼格综合征等不可逆损害，显著缩短生存期。
建议所有确诊患者定期进行心脏超声评估，避免高原旅行等缺氧环境暴露。孕期女性应加强产前筛查，新生儿出现呼吸急促、多汗等症状时需及时排查。术后患者需遵医嘱抗凝治疗，预防血栓形成。
