银杏果可煮熟或炒熟后食用，但需严格控制用量并避免生食。银杏果含有银杏毒素，生食或过量食用可能导致中毒，表现为恶心、呕吐、腹痛等症状。儿童、孕妇及过敏体质者应慎用，食用前建议咨询医生。
银杏果需经高温处理破坏其毒性成分后方可食用。常见方法包括沸水煮10-15分钟或小火炒至外壳开裂。去壳后可将果仁用于煲汤、煮粥，每日食用量建议不超过10粒。银杏果含银杏内酯等活性成分，可能改善微循环，但过量摄入会抑制血小板功能，与抗凝血药物同服可能增加出血风险。胃肠功能较弱者可能出现腹胀腹泻，食用后需观察身体反应。
银杏果外层肉质种皮含致敏原银杏酸，接触皮肤可能引发红肿瘙痒，处理时应戴手套。储存时需保持干燥以防霉变，霉变果仁会产生黄曲霉毒素。若误食生果或出现头晕、肌肉抽搐等中毒症状，应立即催吐并就医。慢性病患者服用前需评估药物相互作用，术后恢复期及经期女性应避免食用。
