近视眼激光矫正可能存在后遗症，但多数情况下症状轻微且可逆。常见后遗症包括干眼、眩光、夜间视力下降等，极少数可能出现角膜混浊或视力回退。手术效果与个体角膜条件、术后护理等因素密切相关。
干眼是术后较常见的暂时性反应，因激光切削会短暂影响角膜神经调节泪液分泌，多数患者在3-6个月内逐渐恢复，可通过人工泪液缓解。眩光与夜间视力下降多与瞳孔大小和切削区设计有关，暗环境下瞳孔直径超过治疗区时可能出现光晕现象，通常术后1年视觉质量会显著改善。角膜上皮愈合不良可能引发轻微异物感，规范使用抗生素滴眼液可有效预防感染。
少数患者可能因角膜愈合异常出现雾状混浊，多见于高度近视或角膜较薄者，需通过二次增效手术处理。视力回退多与术前近视度数不稳定或术后过度用眼相关，严格筛查适应证可降低发生概率。术中角膜瓣并发症如游离瓣、不完全瓣等随着飞秒激光应用已大幅减少，但仍需选择经验丰富的医疗机构。
术后需严格遵医嘱使用氟米龙滴眼液、玻璃酸钠滴眼液等抗炎保湿药物，避免揉眼及游泳1个月。定期复查角膜地形图与眼压，术后1周、1个月、3个月为关键观察节点。建议长期保持20-20-20用眼法则，每20分钟远眺20英尺外20秒，减少电子屏幕使用时间。高度近视者仍需每年检查眼底，激光矫正仅改变屈光状态，不能消除视网膜病变风险。
