正确使用避孕套可以降低支原体、衣原体感染概率，但无法完全杜绝传播风险。支原体和衣原体主要通过性接触传播，避孕套的物理阻隔能减少病原体接触，但若存在皮肤黏膜未覆盖区域的接触或使用不当，仍可能发生感染。
避孕套对支原体衣原体的防护效果取决于规范使用程度。全程正确佩戴合格避孕套，确保覆盖阴茎根部至龟头全部区域，且在性行为前佩戴、结束后及时取下，可显著减少体液交换和黏膜接触。研究显示规范使用下防护效率较高，但病原体可能通过会阴部皮肤接触或避孕套未覆盖的生殖器区域传播。避孕套破损、滑脱或重复使用会完全丧失防护作用。
支原体衣原体感染风险与性行为方式密切相关。口交、肛交等非阴道性交行为中，若未全程使用避孕套或使用非专用型号，防护效果会下降。女性外阴、男性阴囊等部位的皮肤黏膜直接接触也可能导致传播。特殊情况下，感染者分泌物污染手指后再接触黏膜，或共用未消毒性玩具等间接接触途径，避孕套无法提供任何保护。
建议存在感染风险者定期进行生殖道病原体筛查，出现尿频、尿道分泌物等症状时及时就医。可遵医嘱使用阿奇霉素片、多西环素胶囊、左氧氟沙星片等药物治疗。日常保持单一性伴侣，避免高危性行为，配合避孕套使用可多维度降低感染概率。
