生吃洋葱有助于抗氧化、抗炎、调节血脂和血糖，但可能刺激胃肠黏膜。洋葱含有硫化物、槲皮素等活性成分，适合健康人群适量食用。
洋葱中的有机硫化合物如大蒜素具有抗菌作用，能抑制幽门螺杆菌等病原微生物生长。这类物质通过干扰细菌酶系统发挥效果，对预防消化道感染有一定帮助。槲皮素作为黄酮类化合物，可清除自由基并抑制炎症因子释放，长期摄入可能降低心血管疾病风险。洋葱的膳食纤维与低聚果糖能促进双歧杆菌增殖，改善肠道微生态平衡，但过量可能引发腹胀。
胃肠功能较弱者生食洋葱可能出现烧心、反酸等症状，因其刺激性强可能诱发胃炎发作。生洋葱含有的丙烯醛会刺激泪腺分泌，切制时可能引起眼部不适。部分人群食用后会出现口臭或体味加重，这与硫化物代谢产物有关。糖尿病患者需注意洋葱虽含降糖成分，但过量摄入可能干扰血糖监测结果。
建议将洋葱作为配菜少量生食，每日摄入量控制在50克以内。食用后可咀嚼茶叶或苹果帮助消除口气，胃肠敏感者宜用橄榄油凉拌降低刺激性。出现持续腹痛或过敏反应应及时停用并就医，服用抗凝药物者需咨询医生以避免与洋葱活性成分相互作用。
