眼睑基底细胞癌的生存期通常较长，早期患者经过规范治疗5年生存率可达90％以上。具体预后与肿瘤分期、治疗时机及个体差异有关。
眼睑基底细胞癌属于低度恶性肿瘤，生长缓慢且转移概率较低。局限在原位的肿瘤通过手术完整切除后，多数患者可获得长期生存。若肿瘤直径小于10毫米且未侵犯深层组织，局部切除联合术后随访即可达到较好效果。部分患者可能出现局部复发，但二次手术仍能有效控制病情。术后需每3-6个月进行眼科检查，监测是否有新发病灶或异常增生。
当肿瘤侵犯眼睑全层或扩散至眼眶时，治疗难度会增加。侵犯深度超过2毫米或累及睑缘全长的病例，可能需要Mohs显微描记手术确保切除干净。晚期病例若发生远处转移，需结合放疗或靶向治疗，此时5年生存率会有所下降。合并免疫抑制状态或着色性干皮病等基础疾病者，预后相对较差。肿瘤位于内眦部者复发风险较高，需更密切的随访观察。
确诊后应及时到眼科或肿瘤专科就诊，根据病理结果制定个体化方案。术后注意保持术区清洁，避免揉眼或外力撞击。日常做好防晒措施，佩戴防紫外线眼镜，定期进行全身皮肤检查。均衡饮食保证优质蛋白摄入，适当补充维生素A和维生素C有助于创面修复。保持规律作息和良好心态对预后改善具有积极作用。
