HPV感染可能自行消失，也可能持续存在或进展为疾病。HPV感染能否自行消退主要与病毒型别、感染者免疫状态等因素相关。
低危型HPV感染引起的生殖器疣等病变，部分患者可通过自身免疫系统清除病毒，病变可能在数月到两年内自行消退。免疫系统功能正常的年轻女性中，约70％的HPV感染可在1-2年内转阴。病毒清除过程中可能出现疣体脱落、局部黏膜修复等现象，通常无须特殊治疗，但需定期复查确认病毒载量变化。
高危型HPV持续感染可能引发宫颈病变等严重后果。16型、18型等高危HPV若持续感染超过两年，可能诱发宫颈上皮内瘤变，此时病毒自行清除概率显著降低。免疫功能低下、长期使用免疫抑制剂等人群更易出现持续感染。此类情况需通过阴道镜活检评估病变程度，必要时采用激光消融或锥切术等治疗，同时需监测病毒载量及TCT检查结果。
无论是否用药，HPV感染者均应保持规律作息、均衡饮食以增强免疫力，避免吸烟等损害免疫力的行为。性生活时使用避孕套可降低病毒传播风险，但无法完全阻断感染。建议每6-12个月复查HPV分型检测，女性需配合宫颈细胞学检查。出现异常阴道分泌物接触性出血等症状时需及时就医。
