基孔肯雅热主要通过蚊虫叮咬传播，常见传播媒介为埃及伊蚊和白纹伊蚊。该病毒不会通过人与人直接接触传播，但可通过母婴垂直传播或血液暴露途径感染。
埃及伊蚊和白纹伊蚊叮咬感染者后，病毒在蚊体内繁殖并通过再次叮咬传播给健康人群。这些蚊媒多在白天活动，常见于积水容器周围。病毒潜伏期通常为2-4天，患者发病前1-2天至发病后5-6天具有传染性。热带和亚热带地区因蚊媒活跃度高，传播风险显著增加。
母婴传播主要发生在分娩过程中，当母亲处于病毒血症期时可能传染给新生儿。极少数情况下，通过输血或器官移植等医疗操作也可能导致传播。实验室工作人员处理含病毒样本时若发生暴露，也存在职业感染风险。这些非蚊媒传播途径虽概率较低，但仍需采取防护措施。
预防基孔肯雅热需重点做好防蚊灭蚊工作，清除居住环境积水容器，使用蚊帐和驱蚊剂。前往疫区时应穿着长袖衣物，出现发热、关节痛等症状需及时就医并告知旅行史。目前尚无特效抗病毒药物，治疗以缓解症状为主。
