马鞭草具有清热解毒、活血散瘀、利水消肿等功效，主要用于治疗咽喉肿痛、跌打损伤、水肿等症状。
马鞭草性凉味苦，能清除体内热毒，对风热感冒引起的咽喉肿痛、牙龈肿痛有缓解作用。其含有的马鞭草苷等成分可抑制金黄色葡萄球菌等病原微生物生长。临床常与金银花、连翘配伍使用，治疗急性扁桃体炎时可遵医嘱使用马鞭草颗粒。
该药材能促进局部血液循环，改善瘀血阻滞引起的关节肿痛、跌打损伤。其有效成分可降低血液黏稠度，对瘀血型痛经也有改善作用。外伤淤血时可配合红花油外涂，内服可选用含有马鞭草的复方伤痛胶囊。
通过增加肾小球滤过率促进水分代谢，适用于肾炎水肿、肝硬化腹水等病症。马鞭草中的钾离子可调节电解质平衡，与茯苓、泽泻配伍能增强利尿效果。肾功能不全者使用马鞭草片时需监测尿量变化。
马鞭草提取物能抑制前列腺素合成，减轻类风湿关节炎的关节肿胀。对神经性疼痛也有缓解作用，可配合使用马鞭草注射液进行穴位注射治疗。
其乙醇提取物对蛔虫、绦虫有麻痹作用，传统用法是与槟榔、南瓜子配伍驱虫。现代制剂如马鞭草驱虫丸可用于肠道寄生虫病，但孕妇禁用。
使用马鞭草需注意脾胃虚寒者慎用，长期服用可能引起胃肠不适。建议在中医师指导下根据体质配伍用药，避免与寒凉药物同用。日常可配合艾叶泡脚改善血液循环，饮食宜清淡易消化，避免辛辣刺激食物影响药效发挥。
