肝囊肿合并脂肪肝可通过生活方式调整、药物治疗、囊肿穿刺引流、手术切除等方式治疗。肝囊肿通常为良性病变，脂肪肝多与代谢异常相关，两者并存时需综合评估病情严重程度。
1、生活方式调整控制体重和改善饮食结构有助于减轻脂肪肝。减少高脂高糖饮食，增加优质蛋白和膳食纤维摄入，每周进行适度有氧运动。
2、药物治疗脂肪肝可遵医嘱使用多烯磷脂酰胆碱、水飞蓟宾、双环醇等护肝药物。肝囊肿若无症状通常无须用药，合并感染时需抗生素治疗。
3、囊肿穿刺引流对于直径超过5厘米或有压迫症状的肝囊肿，可在超声引导下进行穿刺抽液，必要时注入硬化剂防止复发。
4、手术切除巨大囊肿或怀疑恶变时需腹腔镜或开腹手术切除。脂肪肝若进展为肝硬化则可能需肝移植治疗。
定期复查超声和肝功能，避免饮酒和高脂饮食，合并糖尿病或高脂血症者需同步控制基础疾病。
