畸胎瘤恶性可能引发局部浸润、远处转移、器官功能衰竭及恶病质等严重后果，主要与肿瘤分化程度、生长速度、转移部位及治疗时机有关。
恶性畸胎瘤可侵犯周围组织器官，如卵巢畸胎瘤浸润盆腔导致肠梗阻，需手术切除联合放化疗，常用药物包括顺铂、依托泊苷、博来霉素。
肿瘤细胞通过血液或淋巴转移至肺、肝、骨等部位，肺转移可能引起咯血，需靶向治疗联合免疫治疗，药物可选帕博利珠单抗、安罗替尼。
转移灶破坏靶器官功能，如肝转移导致黄疸腹水，需护肝治疗联合全身化疗，药物包括奥沙利铂、卡培他滨。
肿瘤消耗引发极度消瘦和代谢紊乱，需营养支持联合姑息治疗，药物包括甲地孕酮、沙利度胺。
确诊恶性畸胎瘤后应定期监测肿瘤标志物，保持高蛋白饮食并避免剧烈运动，治疗期间需预防感染和血栓形成。
