女性肾结石的原因，跟男性肾结石的原因大同小异。总之，肾结石的原因，形成的过程当中，是某些因素造成了尿中的晶体物质浓度升高，或者是溶解度降低，呈过饱和的状态，析出结晶，并在局部的生长、集聚，最终形成结石。影响结石形成的因素很多，包括，年龄、性别，男性结石比女性要多、男比女是1。种族、遗传、环境因素，南方比北方的结石要多、饮食习惯。有一些地区，处于石灰岩地区，结石发病率也比较高。还有机体的代谢异常，如甲状旁腺功能亢进、皮质醇增多症、高血糖。长期卧床、营养缺乏、维生素B6缺乏、缺镁，尿路的梗阻、感染、尿道的异物和某些药物的使用，都是结石形成的常见原因。
