苍耳子具有发散风寒、通鼻窍、祛风湿、止痛等功效，主要用于风寒头痛、鼻渊流涕、风疹瘙痒、风湿痹痛等症状的治疗。
苍耳子味辛性温，归肺经，能发散风寒，缓解风寒感冒引起的恶寒发热、头痛鼻塞等症状。对于风寒袭表导致的轻微感冒，可配伍防风、白芷等药物增强解表效果。使用苍耳子时需注意其有小毒，不宜过量或长期服用。
苍耳子对鼻渊流涕、鼻塞不通等鼻部症状有显著改善作用。其挥发油成分能刺激鼻黏膜血管收缩，减少分泌物，常与辛夷、鹅不食草等同用治疗慢性鼻炎、过敏性鼻炎。鼻腔干燥出血者慎用。
苍耳子能祛除肌肉关节间的风湿邪气，改善风湿痹痛、关节屈伸不利等症状。临床多与威灵仙、羌活等配伍治疗风湿性关节炎，对游走性关节疼痛效果较好。阴虚血燥者应避免使用。
苍耳子所含的苍耳苷等成分具有镇痛作用，可缓解头痛、牙痛及外伤疼痛。治疗偏头痛时可配伍川芎、白芷，外用捣敷可减轻跌打损伤肿痛。孕妇及体虚者慎用止痛方剂。
苍耳子煎汤外洗能缓解风疹、湿疹等皮肤瘙痒症状，其抗过敏作用对荨麻疹有一定效果。常与地肤子、白鲜皮等配伍制成洗剂，皮肤破溃处禁用。内服过量可能导致恶心呕吐等不良反应。
使用苍耳子需严格遵循医嘱，避免自行采食野生苍耳子。煎煮时应充分去刺并久煎减毒，常规用量为3-10克。服药期间忌食辛辣油腻，出现头晕、口干等不适需立即停用。风湿病患者可配合艾灸关元、足三里等穴位增强疗效，鼻部症状者建议每日热敷鼻梁促进血液循环。
