对于肾石症并发症主要有四方面：疼痛、出血、感染、肾盂积水甚至肾功能损害。因为肾石症主要是位于肾脏内部的结石，而结石是异物，在泌尿系统当中存在,会增加泌尿系感染的风险，患者可能会存在尿路刺激症，导致患者尿频、尿急、尿痛以及结石与肾盂粘膜摩擦会损伤粘膜表面毛细血管，导致红细胞入尿液当中，因此，患者可能会有血尿的发生。对于肾石症的患者需要定期去泌尿外科进行复查，如果肾盂结石或者肾盏内的结石掉入到输尿管当中，容易引起泌尿系梗阻，而梗阻如果没有及时发现，会越来越重，导致患者肾盂积水，长期以往积水越来越重，会损伤肾脏功能，部分患者在发现时由于积水过重，会导致患者无功能肾的产生以及对于结石如果在肾盂内运动或者掉落到输尿管当中，会导致输尿管发生绞痛以及肾盂内高压，患者会有剧烈肾绞痛的发作。
