有巧克力囊肿的患者是可以要孩子的，这个是属于良性病变，确实也有一定的遗传因素。巧克力囊肿主要是看检查到的具体的结果的，如果患者病灶不很大的情况，有一部分人群是可以定期检查观察的，可以直接备孕的。备孕失败的人群也是要同时做了其它不孕症的相关的检查的，比如精液常规和内分泌的检查和排卵的监测、子宫内膜的检查、子宫输卵管造影检查等，都是正常的情况，就要考虑做手术治疗。之后短时间备孕仍然失败的情况，就得考虑尽早的做试管婴儿完成生育了。否则有的人是会因为巧克力囊肿影响到卵巢功能，而导致怀孕的几率越来越小的。
