肺栓塞的临床类型不一样，需要与之鉴别的疾病也不相同。以肺部表现为主要者容易被误诊为其它的胸肺疾病，以肺动脉高压和心脏病为主者，则容易误诊为其它心脏疾病。临床上最易误诊的重要疾病就是心肌梗死、冠状动脉供血不足、肺炎、充血性心力衰竭、心肌病、原发性肺动脉高压、胸膜炎、支气管哮喘、心包炎、夹层动脉瘤及肋骨骨折的，急性心肌梗死、急性肺栓塞可以出现，剧烈胸痛伴有心电图，酷似心肌梗死的图形需要与急性心肌梗死鉴别。第二冠状动脉供血不足，在年龄较大的急性肺栓塞或者是复发性肺栓塞患者心电图上可以出现ⅡⅢAVF导联ST段T波的改变，甚至Ⅰ导联到Ⅳ导联出现冠状T，同时存在胸痛、气短，容易诊断为冠状动脉供血不足或心内膜下心肌梗死。
