肝外胆管结石主要是根据病史、体格检查、实验室检查及影像学检查确诊。1、如果患者有反复发作性右上腹剧痛的病史以及腹痛、寒热、黄疸等夏柯三联症的出现，则高度提示肝外胆管结石合并感染的存在。2、腹部体格检查时患者在剑突下右上腹有压痛，肝区有叩痛，有时可触及肿大的胆囊。3、实验室检查出现胆汁梗阻或感染时胆红素增高，碱性磷酸酶及γ-谷氨酰转肽酶增高，肝外胆管结石的检查有谷草转氨酶及谷丙转氨酶增高，伴有感染时白细胞及中性粒细胞增高。4、影像学检查:B超检查显示胆囊、胆总管及肝总管中有结石，肝总管结石一般胆囊不增大，而常有肝内胆管扩张。胆囊管与肝总管会和部结石则可见胆囊增大，胆囊管及肝总管扩张，而胆总管不扩张。胆总管结石则其近端管道扩张，胆囊增大，但对肝内胆管影响较轻，只有严重梗阻时肝内胆管才见扩张。CT检查可发现结石之部位大小、多少，根据结石的CT结果对判断结石的性质和类型有所帮助。
