生殖器疱疹潜伏期一般为2-14天，实际时间受到病毒载量、免疫状态、感染部位、首次感染或复发以及个体差异等因素影响。
1、病毒载量：
初次感染时病毒复制活跃程度直接影响潜伏期长短。高浓度病毒暴露可能缩短至2-3天出现症状，低剂量接触可能延长至2周。病毒载量通过影响局部黏膜突破速度和神经节迁移效率决定发病时间。
2、免疫状态：
免疫功能健全者潜伏期多维持在7-10天，而艾滋病患者或长期使用免疫抑制剂人群可能缩短至3-5天。细胞免疫应答效率决定病毒在感觉神经节中的潜伏激活速度。
3、感染部位：
阴茎冠状沟等皮肤黏膜薄弱处潜伏期较短平均5天，角质层较厚的会阴部可能延长至12天以上。不同部位上皮细胞对单纯疱疹病毒2型的易感性存在显著差异。
4、感染类型：
原发性感染典型潜伏期为4-7天，复发感染因体内存在记忆免疫反应，潜伏期可缩短至1-3天。病毒再激活时无需经历完整的皮肤入侵和神经传导过程。
5、个体差异：
基因多态性导致部分人群疱疹病毒受体表达量不同，潜伏期存在1-5天的生理性波动。HLA-DQ抗原呈递效率等遗传因素也会影响病毒识别速度。
潜伏期患者虽无症状但仍具传染性，建议避免性接触并保持患处清洁干燥。急性期应选择棉质透气内衣，恢复期可适当补充富含赖氨酸的乳制品和鱼类，限制精氨酸含量高的坚果类食物摄入。适度有氧运动有助于增强免疫功能，但发作期应暂停剧烈运动。复发频繁者需进行系统性免疫功能评估。
