经皮肾镜对肾脏的影响通常较小，但具体需根据患者病情及操作规范评估。该技术主要用于肾结石等疾病的微创治疗，术后可能出现短暂性肾功能波动或轻微损伤。
经皮肾镜手术通过皮肤小切口建立通道直达肾脏，创伤远小于开放手术。术中采用影像引导精准定位，可最大限度保护正常肾组织。多数患者术后仅表现为轻微血尿或腰部不适，1-2周内可恢复。规范操作下对肾小球滤过率的影响有限，不会造成永久性肾功能损害。术后通过补液、抗感染等处理，能有效预防并发症。
少数情况下可能出现严重出血、尿外渗或感染等并发症，多见于复杂结石、肾功能基础较差或存在解剖变异的患者。术中穿刺角度偏差可能损伤肾血管，导致血红蛋白下降或肾周血肿。术后发热超过38.5摄氏度可能提示尿路感染，需及时进行尿液培养和药敏试验。长期随访数据显示，规范手术对肾脏远期功能无显著负面影响。
术后应保持每日饮水量2000毫升以上，避免剧烈运动1个月。定期复查泌尿系超声和肾功能指标，观察结石清除情况及肾脏恢复状态。出现持续血尿、腰痛加重或尿量减少时需立即就医。合并高血压或糖尿病的患者需严格控制基础疾病，以降低肾脏负担。
