经皮肾镜对肾脏的影响通常较小，属于微创手术范畴。手术风险主要与患者个体差异、操作技术及术后护理有关。
手术仅需约5毫米穿刺通道，肾实质损伤范围有限，术后瘢痕面积约为黄豆大小，远低于开放性手术。
健康肾脏代偿能力强，单次手术对肾功能影响轻微，术后3-6个月复查显示多数患者肾小球滤过率波动在正常范围内。
出血和感染是主要短期风险，发生率不足5％，严重出血需介入处理的情况更低于1％，术中超声引导可显著降低周围脏器损伤概率。
规范操作下不会导致慢性肾功能损害，但反复多次手术可能增加肾周粘连风险，结石复发患者需评估再次手术必要性。
术后建议保持每日2000毫升饮水量，避免剧烈运动1个月，定期复查泌尿系超声和肾功能指标，出现持续腰痛或血尿需及时复诊。
