新生儿结膜炎可能自愈，但需根据病因决定。细菌性或病毒性结膜炎通常需要治疗，轻微刺激或泪管堵塞可能自行缓解。新生儿结膜炎常见原因有产道感染、细菌感染、病毒感染、泪管发育不全、外界刺激等。
新生儿结膜炎若由分娩时接触母亲产道内的细菌或病毒引起，如淋球菌、衣原体等，通常无法自愈且可能迅速进展。这类感染需立即就医，医生可能开具红霉素眼膏、妥布霉素滴眼液等抗生素药物，延误治疗可能导致角膜溃疡甚至失明。早产儿或免疫力低下患儿更易出现严重并发症，家长发现眼睑红肿、黄色脓性分泌物时应及时就诊。
部分新生儿因泪管未完全发育通畅导致分泌物滞留，表现为眼部分泌物增多但无红肿疼痛。这种情况可通过轻柔按摩内眼角促进泪管开放，配合生理盐水清洁眼周，多数在出生后数月内自愈。若持续超过6个月需考虑泪管探通术。日常护理中避免用不洁物品擦拭眼睛，母乳喂养的婴儿可滴入少量母乳辅助消炎。
家长应每日观察新生儿眼部情况，发现异常分泌物增多、结膜充血或畏光流泪时，避免自行用药或拖延。保持婴儿用品清洁消毒，接触患儿前后彻底洗手。母乳喂养有助于增强免疫力，室内湿度维持在适宜范围减少刺激。若症状持续超过48小时或加重，须立即前往儿科或眼科专科就诊，避免并发症发生。
