四联疗法一般需要10-14天，实际疗程可能受到幽门螺杆菌耐药性、患者用药依从性、药物不良反应、胃黏膜病变程度等因素影响。
1、耐药性影响幽门螺杆菌对克拉霉素或甲硝唑耐药可能降低疗效，需通过药敏试验调整方案，常用药物包括奥美拉唑、阿莫西林、克拉霉素、枸橼酸铋钾。
2、用药依从性漏服药物可能导致治疗失败，建议设置服药提醒，联合用药包含质子泵抑制剂、两种抗生素和铋剂四类成分。
3、不良反应腹泻或过敏等药物反应可能中断治疗，出现严重不适时应及时复诊调整方案，备选药物有雷贝拉唑、四环素、左氧氟沙星等。
4、病变程度伴有胃溃疡或萎缩性胃炎者可能需要延长疗程，胃镜检查可评估黏膜修复情况，必要时联用胃黏膜保护剂。
治疗期间应避免饮酒，规范完成整个疗程后需间隔4周复查碳13呼气试验，确认幽门螺杆菌根除效果。
