吃黑色巧克力通常能抗氧化，其含有的可可多酚类物质有助于清除自由基。黑巧克力中富含黄酮类化合物、原花青素等成分，适量摄入对延缓细胞氧化损伤有潜在益处。
黑巧克力的抗氧化作用主要来源于可可固形物含量较高，可可含量超过70％的黑巧克力抗氧化效果更显著。可可豆在发酵过程中产生的多酚类物质经人体吸收后，可抑制低密度脂蛋白氧化，减少血管内皮炎症反应。实验研究表明，每日摄入20-30克高纯度黑巧克力能提升血液中抗氧化酶活性，但需注意选择糖分添加量低于5％的产品以避免热量过剩。
部分人群食用黑巧克力可能无法获得理想抗氧化效果。胃肠功能较弱者可能对多酚类物质吸收率较低，糖尿病患者需严格控制摄入量以防血糖波动。采用碱化工艺加工的可可粉会破坏50％以上的多酚成分，选购时应注意成分表中是否标注"非碱化"工艺。对可可过敏者可能出现皮肤瘙痒或消化道不适，此类人群应避免食用。
建议将黑巧克力作为均衡饮食的补充，搭配深色浆果、坚果等富含维生素E的食物可协同增强抗氧化效果。食用后出现心悸或头痛等不适时应立即停用，肥胖人群每周摄入量不宜超过100克。储存时应避光防潮以保留活性成分，开封后建议两周内食用完毕。
