重度脑炎存在治愈可能，但预后与脑损伤程度、病原体类型、治疗时机等因素密切相关，主要治疗手段包括抗感染治疗、降颅压治疗、免疫调节治疗、生命支持治疗。
针对细菌性脑炎可使用头孢曲松、万古霉素等抗生素，病毒性脑炎需用阿昔洛韦、更昔洛韦等抗病毒药物，真菌感染则选用两性霉素B。
甘露醇、高渗盐水等脱水剂可缓解脑水肿，严重时需行去骨瓣减压术，同时需监测电解质平衡。
自身免疫性脑炎需静脉注射免疫球蛋白或激素冲击治疗，部分病例需使用利妥昔单抗等生物制剂。
昏迷患者需气管插管维持呼吸，癫痫持续状态需丙戊酸钠静脉给药，多器官衰竭需ICU综合救治。
早期康复训练有助于神经功能恢复，治疗期间需严格监测意识状态、生命体征及并发症，后遗症患者需长期进行认知功能训练和肢体康复。
