生吃大蒜可能引起胃肠刺激、口腔异味、过敏反应等问题，特殊人群需谨慎食用。
大蒜含有大蒜素等活性成分，直接生吃可能刺激胃肠黏膜，空腹时更易引发胃部灼热感或腹痛。部分人群食用后会出现腹胀、腹泻等消化不良症状，与大蒜促进胃酸分泌的特性有关。口腔中残留的硫化物可导致长时间口臭，刷牙也难以完全消除，可能影响社交活动。少数人可能对大蒜中的蛋白质成分过敏，出现皮肤瘙痒、红肿或呼吸道不适，严重时需立即就医。长期大量生吃可能抑制肠道正常菌群，尤其对胃肠功能较弱者可能加重原有疾病。
建议控制生大蒜单次摄入量在1-3瓣，搭配主食可减轻刺激。食用后可用绿茶漱口或咀嚼生花生减轻口气。胃肠疾病患者、术前术后人群、服用抗凝药物者应避免生食。若出现持续腹痛、皮疹等不适，应及时停止食用并咨询医生。日常可通过熟制大蒜获得营养，既能保留部分活性成分又可降低刺激性。
