月经期间通常可以做核磁共振检查，但需根据个体情况调整检查时间。核磁共振检查一般不会对月经周期或经量产生直接影响，但部分女性在月经期可能出现不适症状，可能影响检查配合度。
核磁共振检查无电离辐射，其工作原理是通过磁场和射频脉冲获取人体组织图像，与月经生理过程无冲突。对于常规妇科检查或非紧急情况，建议避开月经量多的前三天，以免因腹痛、乏力等症状影响检查体位保持。若需进行盆腔核磁共振，经血可能干扰图像质量，可考虑在月经结束后复查。
少数情况下需谨慎评估，如存在严重痛经伴呕吐、失血性贫血或使用镇静药物等情况时，可能需推迟检查。安装含金属成分的卫生棉条者应提前告知虽然现代卫生用品多采用非磁性材料，但需确认安全性。进行增强核磁共振时，月经期血管通透性改变可能影响造影剂代谢，需由放射科医生综合判断。
检查前建议穿着宽松棉质衣物，使用无金属扣的卫生巾。检查过程中保持放松，若出现明显不适可立即示意操作人员。月经周期紊乱或长期异常出血者，应优先排查妇科疾病后再安排影像学检查。具体检查时机可咨询临床根据检查部位和个体耐受度综合决定。
核磁共振一般能较为准确地检查出恶性肿瘤。
核磁共振成像利用磁场和无线电波生成人体内部结构的详细图像，对软组织分辨率高，能清晰显示肿瘤的位置、大小及与周围组织的关系。对于脑部、脊柱、乳腺、肝脏等部位的恶性肿瘤，核磁共振可检出小至几毫米的病灶，并通过增强扫描判断肿瘤血供特征。部分恶性肿瘤如胶质瘤、肝癌在核磁共振上有典型表现，如T1加权像低信号、T2加权像高信号、弥散受限等。但某些低度恶性或早期肿瘤可能与其他良性病变影像表现重叠，需结合病理活检确诊。
检查前需去除金属物品，体内有心脏起搏器或金属植入物者禁止检查。
