美克尔憩室可能引起肠梗阻、消化道出血、憩室炎、肠套叠、肠瘘等后遗症。美克尔憩室是先天性回肠末端的囊状突起，多数患者无症状，部分可能出现并发症需及时干预。
美克尔憩室可能因憩室扭转或与周围组织粘连导致肠腔狭窄，引发机械性肠梗阻。患者表现为腹痛、呕吐、腹胀及停止排气排便，严重时可出现肠缺血坏死。治疗需禁食胃肠减压，必要时行肠粘连松解术或憩室切除术，常用药物包括头孢曲松钠注射液、奥美拉唑肠溶胶囊、蒙脱石散等。
憩室内异位胃黏膜分泌胃酸可腐蚀肠壁血管，导致无痛性便血或黑便，儿童患者多见。出血量较大时可能引起贫血甚至休克。确诊后需静脉补液止血，必要时内镜下止血或手术切除憩室，常用药物有氨甲环酸注射液、云南白药胶囊、琥珀酸亚铁片等。
憩室内容物淤积可能继发细菌繁殖，出现类似阑尾炎的右下腹痛伴发热。炎症扩散可导致憩室穿孔或腹膜炎。治疗需静脉输注抗生素如左氧氟沙星氯化钠注射液、甲硝唑片，并禁食补液，反复发作者建议手术切除。
憩室作为肠管内的牵引点可能诱发回肠-回肠型或回肠-结肠型肠套叠，表现为阵发性腹痛、果酱样大便及腹部包块。早期可通过空气灌肠复位，失败时需手术复位并行憩室切除术，术后可配合双歧杆菌三联活菌胶囊调节肠道菌群。
慢性憩室炎可能穿透肠壁与膀胱、阴道等邻近器官形成病理性通道，导致粪尿或阴道排粪。需通过造影明确瘘管走向后手术切除瘘管及受累肠段，术前可使用头孢哌酮舒巴坦钠预防感染，术后需肠外营养支持。
美克尔憩室患者日常需避免剧烈运动及腹部外伤，出现持续腹痛、便血或发热时应立即就医。饮食上选择低渣易消化食物，限制辛辣刺激及高纤维摄入，定期复查腹部超声监测憩室变化。无症状者无须特殊处理，但需告知医生存在该病史以便在急腹症鉴别诊断时考虑。
