避孕套可以降低性传播疾病的感染概率，但不能完全杜绝风险。
避孕套的物理屏障作用能有效阻隔精液、阴道分泌物等体液的直接接触，从而减少艾滋病、淋病、衣原体感染等通过性行为传播的病原体传播机会。乳胶或聚氨酯材质的避孕套对直径超过病毒大小的颗粒具有阻隔效果，正确使用可使艾滋病病毒传播风险降低。但避孕套无法覆盖所有可能发生皮肤接触的生殖器区域，例如阴囊、外阴等部位若存在疱疹、尖锐湿疣等皮损时，仍可能通过皮肤接触传播。
梅毒、生殖器疱疹等疾病可通过避孕套未覆盖的皮肤溃疡或黏膜破损处传播，人乳头瘤病毒也可能通过外生殖器皮肤接触感染。避孕套使用过程中出现滑脱、破裂或未全程佩戴等情况时防护效果会显著下降。建议结合定期医学筛查、单一性伴侣等综合措施加强防护。
性行为前后应注意清洁，避免共用毛巾等个人物品，出现异常症状及时就医。
