电子肠镜检查过程中可能会有轻微不适感，但多数患者可以耐受。检查前会使用镇静药物减轻痛苦，具体感受因人而异。
电子肠镜检查时，医生会将带有摄像头的软管从肛门插入，逐步推进至结肠。检查过程中可能出现腹胀、牵拉感或短暂绞痛，这些不适通常与肠道充气和器械移动有关。现代肠镜设备直径较细且柔软，配合润滑剂使用能减少摩擦刺激。多数患者在静脉注射镇静剂后处于浅睡眠状态，对疼痛感知明显降低。检查时间一般在15-30分钟，操作熟练的医生能更快完成。部分敏感人群可能在转弯处有较强便意，但不会持续超过1分钟。
少数肠道结构异常或既往腹部手术史的患者可能体验较强痛感。肠道严重粘连、憩室炎急性期或肠管极度弯曲时，器械通过阻力增大可能引发痉挛性疼痛。炎症性肠病活动期患者黏膜脆弱，充气扩张时疼痛阈值更低。儿童、消瘦者及痛觉敏感人群对机械刺激反应更明显。这类情况医生会调整充气量、改变体位或追加镇痛药物，必要时改为无痛肠镜检查。
检查后1-2天内可能出现轻微腹胀或隐痛，可通过热敷和轻柔按摩缓解。建议选择正规医疗机构进行操作，术前与医生充分沟通自身健康状况。检查前3天保持低渣饮食，严格按医嘱清洁肠道能提升检查舒适度。若既往有麻醉药物过敏或心肺疾病，需提前告知医生调整方案。
