发病原因真菌是慢性肉芽肿性关节炎的常见致病因子。各种真菌都可以引起骨关节病变。侵害筋骨系统的最常见真菌是粗球孢子菌、荚膜组织胞浆菌、皮炎芽生菌、申氏孢子丝菌和免疫机能障碍者的念珠菌、曲霉、隐球菌和组织胞浆菌等。二、发病机制真菌感染关节的方式，很少由血行性传播感染，大多是由于邻近关节的骨骼真菌性病灶，直接扩散到关节。孢子丝菌还可以经皮肤及皮下直接侵入关节。球孢子菌由呼吸道吸入肺，也可由皮肤微小损伤进入皮肤，引起原发性肺或皮肤感染。
治疗使用两性霉素B静脉滴注和关节内注射，或用酮康唑、克霉唑口服。病灶清除是缩短治疗时间和治愈关节炎的重要手段。1.念珠菌病治疗首先要去除患病诱因，再用两性霉素B关节内注射和静脉滴注，或者用酮康唑、克霉素口服。也可以采用手术清除关节内病灶方法来治疗。2.孢子丝菌病治疗上，据报道碘制剂疗效较好。配合以手术清除肉芽肿性滑膜效果可更好。也有用关节内碘化物注射治疗的报道。3.芽生菌关节炎用两性霉素B静脉滴注和关节内注射，效果非常好。4.球孢子菌病治疗播散性病例，强调两性霉素B或酮康唑足量使用。手术切除肉芽肿结节，可缩短病程。
