常吃半生食海鲜可能增加寄生虫感染和细菌性食物中毒的风险，通常不建议长期食用。半生食海鲜可能携带副溶血性弧菌、创伤弧菌、异尖线虫等病原体，也可能因储存不当导致组胺中毒。
海鲜未经充分加热可能残留寄生虫幼虫或虫卵，例如生食三文鱼可能感染阔节裂头绦虫，牡蛎等贝类可能携带诺如病毒。部分人群食用后会出现急性胃肠炎症状，表现为腹痛、腹泻、呕吐等。某些海鱼体内天然存在的组氨酸在腐败过程中转化为组胺，即使高温烹饪也无法破坏，可能引发皮肤潮红、头痛等过敏反应。
特殊情况下食用需确保食材来源可靠，深海鱼类经过专业冷冻处理可降低寄生虫风险。日本料理中的刺身通常选用养殖鱼类并经过超低温冷冻，相对安全性较高。孕妇、儿童、老年人及免疫力低下者应完全避免生食海鲜，肝硬化患者接触创伤弧菌可能引发败血症。
建议选择彻底煮熟的海鲜，烹饪时中心温度达到70摄氏度并持续1分钟以上可杀灭大部分病原体。处理生熟食材需分开案板，食用后出现持续腹痛、发热或神经系统症状需立即就医。日常可搭配芥末、醋等调料辅助杀菌，但无法替代加热处理效果。
