白芷对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、白色念珠菌、绿脓杆菌等常见致病菌具有抑制作用，其挥发油及活性成分可通过破坏菌体结构干扰代谢发挥作用。
白芷中的欧前胡素能抑制该菌细胞壁合成，对耐药性金黄色葡萄球菌仍有效，临床可配合头孢氨苄胶囊、莫匹罗星软膏等药物使用。
白芷提取物可破坏大肠杆菌生物膜结构，常与盐酸小檗碱片、诺氟沙星胶囊联用治疗肠道感染，需注意孕妇禁用相关药物。
白芷挥发油对真菌细胞膜麦角甾醇有靶向作用，可与克霉唑栓、氟康唑胶囊联合治疗真菌性阴道炎，使用前需排除药物过敏史。
白芷香豆素类成分能阻断绿脓杆菌群体感应系统，严重感染时需配合注射用头孢他啶、妥布霉素注射液等抗生素治疗。
使用含白芷的中成药或方剂前应咨询中医师，避免与抗凝药物同用，过敏体质者需进行皮肤测试确认安全性。
