甲状腺疾病多数可以控制或治愈，治疗效果与疾病类型有关，主要有甲状腺功能亢进症、甲状腺功能减退症、甲状腺炎、甲状腺结节等。
1、甲状腺功能亢进症甲状腺功能亢进症可通过抗甲状腺药物、放射性碘治疗或手术治疗控制，常用药物包括甲巯咪唑、丙硫氧嘧啶等，多数患者经规范治疗可恢复正常生活。
2、甲状腺功能减退症甲状腺功能减退症需终身补充甲状腺激素，常用左甲状腺素钠片，定期监测激素水平可维持正常代谢功能，预后良好。
3、甲状腺炎亚急性甲状腺炎具有自限性，通常数月内自愈；桥本甲状腺炎需根据甲状腺功能状态决定是否干预，部分患者最终需激素替代治疗。
4、甲状腺结节良性结节无须特殊治疗，恶性结节需手术切除，术后可能需放射性碘治疗，五年生存率超过90％。
甲状腺疾病患者应定期复查甲状腺功能，保持均衡饮食，避免过量摄入海带紫菜等高碘食物，遵医嘱规范治疗。
