卵巢囊肿与巧克力囊肿（子宫内膜异位囊肿）的主要区别在于病因、病理特征及症状表现，前者多为生理性或良性肿瘤，后者属于子宫内膜异位症的特殊类型。
1. 病因差异：卵巢囊肿可能由卵泡未破裂或黄体持续存在等生理性因素引起，巧克力囊肿则因子宫内膜组织异位种植至卵巢，伴随周期性出血形成陈旧性积血。
2. 病理特征：普通卵巢囊肿囊液清亮或淡黄色，囊壁光滑；巧克力囊肿囊液呈暗褐色黏稠状，囊壁与周围组织粘连，显微镜下可见子宫内膜腺体及间质。
3. 症状表现：生理性卵巢囊肿常无症状，病理性者可能伴随腹胀；巧克力囊肿典型表现为进行性加重的痛经、性交痛及不孕，超声检查可见"毛玻璃样"回声。
4. 治疗方式：无症状卵巢囊肿可观察随访，较大囊肿需腹腔镜切除；巧克力囊肿需药物抑制内膜生长或手术清除病灶，复发率高需长期管理。
建议定期妇科超声检查，若出现异常腹痛或月经改变应及时就诊，避免剧烈运动以防囊肿破裂。
