脑寄生虫病多数情况下可以治愈，治疗效果主要与寄生虫种类、感染程度、治疗时机及患者基础健康状况有关。
不同寄生虫对药物敏感性差异较大，如脑囊尾蚴病常用阿苯达唑联合吡喹酮，而弓形虫感染需磺胺嘧啶联合乙胺嘧啶。
早期局限性感染治愈率较高，若已形成脑实质广泛损害或肉芽肿，可能需手术切除联合抗寄生虫治疗。
出现头痛、癫痫等神经系统症状后立即干预效果较好，延误治疗可能导致不可逆神经损伤。
免疫功能低下者易复发，需延长疗程；合并脑水肿或颅内压增高时需同步进行脱水降颅压治疗。
规范用药后需定期复查头颅影像学，避免生食淡水鱼虾等高风险食物，出现视力改变或运动障碍应及时复诊。
