减毒活疫苗与灭活疫苗主要通过病原体活性、免疫效果、适用人群和储存条件四个方面区分。减毒活疫苗含有弱化活病原体，灭活疫苗使用已灭活的完整病原体或成分。
1、病原体活性减毒活疫苗通过实验室弱化病原体保留繁殖能力但不致病，如麻疹疫苗；灭活疫苗的病原体经化学或物理方法完全灭活，如狂犬病疫苗。
2、免疫效果减毒活疫苗通常接种1剂即可产生长期免疫，模拟自然感染过程；灭活疫苗需多次接种才能维持足够抗体水平，如乙肝疫苗需3剂。
3、适用人群减毒活疫苗不适用于免疫功能低下者，如HIV感染者；灭活疫苗安全性更高，可用于绝大多数人群包括孕妇。
4、储存条件减毒活疫苗对温度敏感，需严格冷链运输；灭活疫苗稳定性较强，部分品种可常温保存一定时间。
接种前应告知医生自身健康状况，疫苗选择需结合个体差异与流行病学特征，两类疫苗均需在国家指定机构规范接种。
