B族链球菌取样一般不会引起明显疼痛，但可能伴随轻微不适感。B族链球菌检测主要通过阴道和直肠拭子取样完成，操作过程快速且创伤极小。
B族链球菌取样时，医护人员会使用专用棉签在阴道下1/3处及直肠括约肌外缘轻轻旋转擦拭数秒。由于取样区域神经分布较少，多数人仅感觉轻微压迫或异物感，类似常规妇科检查的不适程度。取样过程通常5-10秒即可完成，无需麻醉或特殊准备。妊娠期女性因激素变化可能导致黏膜敏感度增加，但疼痛感仍多属于可耐受范围。
极少数情况下，若受检者存在外阴炎、肛裂等局部炎症，或对检查过度紧张导致肌肉痉挛，可能暂时增强不适感。医护人员可通过调整取样力度、指导放松呼吸等方式缓解。取样后可能出现短暂瘙痒或少量分泌物，这些反应多在1-2小时内自行消失。
建议检测前清洁外阴但避免冲洗阴道，穿着宽松衣物方便检查。取样后保持会阴干燥，24小时内避免性生活或盆浴。若出现持续灼痛、异常出血等情况应及时就医。B族链球菌筛查对预防新生儿感染具有重要意义，建议所有孕妇在妊娠35-37周接受检测。
