本病最有效的治疗药物是红霉素类，但由于红霉素可引起比较严重的胃肠道反应，目前其他大环内酯类抗生素，如交沙霉素，麦迪霉素，螺旋霉素、白霉素、美欧卡霉素等。新一代大不内酯类抗生素如罗红霉素类、阿奇霉素等由于服药次数少，副作用低而受到家长及患儿欢迎。其他治疗细菌性肺炎的药如青霉素。头孢菌素类对支原体菌无效。由于支原体肺炎在退烧后呼吸道症状如咳嗽等消退很慢，有的还可复发，故专家主张疗程延长至2-4周。至于治疗费用没有固定的价格，每个医院有每个医院的价格。大概在100多不到200的样子。
关于支原体感染的治疗，是需要根据具体的情况来考虑的。主要是感染的部位，程度，时间的长短等等。具体的费用更是需要根据具体的治疗情况来考虑的。一般来讲花费并不大。必要时可以首先进行培养和药敏试验，然后选用敏感的药物进行治疗，可以避免走弯路。
