第一点、肾小球病变。这是系统性红斑狼疮肾炎最为常见而重要的病变。基本病变包括：细胞增生：主要为系膜细胞及内皮细胞增殖，可有新月体形成。免疫复合物沉积：可广泛沉积于系膜区、基底膜内、上皮下和内皮下。以IgG为主，常伴IgM、IgA、C3、C4和Clq沉积，如IgG、IgM、IgA均阳性，称"满堂亮影现象。大量免疫复合物如沉积在内皮下使毛细血管壁增厚，称"白金耳环"现象；如沉积在毛细血管腔，则形成透明血栓。毛细血管袢纤维素样坏死：可见坏死的细胞核，称为核碎片。炎症细胞浸润：主要为单核一巨噬细胞和T淋巴细胞。
第二点、肾小管一间质病变。可见于50％以上的LN，尤其是Ⅵ型LN。表现为小管和间质的炎症细胞浸润；小管萎缩和间质纤维化。免疫复合物在肾小管基底膜呈颗粒样沉积。
第三点、肾内小血管病变、表现为免疫复合物沉积在血管壁、透明样血栓、非炎症性坏死和血管炎。病理表现是LN判断预后和指导治疗的主要依据。反映病情活动的指标为：严重的系膜和内皮细胞增生，伴或不伴粒细胞浸润；核碎片；大量内皮下免疫复合物沉积（白金耳环样改变）；透明血栓形成；肾小球基膜断裂；细胞性或纤维细胞性新月体；毛细血管袢纤维素样坏死。其中后两者更为重要。反映慢性病变的指标为：肾小球硬化；纤维性新月体；肾小管萎缩；间质纤维化。
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