恶心为最常见伴随症状，达一半以上，且常为中、重度恶心。恶心可先于头痛发作，也可于头痛发作中或发作后出现。近一半的患者出现呕吐，有些患者的经验是呕吐后发作即明显缓解。不少患者还可出现视物不清、畏光畏声及其他自主功能障碍，如尿频、排尿障碍、鼻塞、心慌、高血压、低血压、甚至可出现心律失常。发作累及脑干或小脑者可出现眩晕共济失调、复视、听力下降、耳鸣、意识障碍等。头痛缓解后可出现怠倦、昏昏欲睡。有的感精疲力竭、饥饿感或厌食、多尿、头皮压痛、肌肉酸痛。也可出现精神心理改变，如烦躁、易怒、情绪低落、少语、少动等。
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甲状腺切除术可能出现的并发症包括喉返神经损伤、甲状旁腺功能减退、术后出血等。
甲状腺切除术中喉返神经损伤可能导致声音嘶哑或饮水呛咳，多数为暂时性，少数可长期存在。甲状旁腺功能减退会引起低钙血症，表现为手足麻木或肌肉痉挛，需长期补钙治疗。术后出血可能形成血肿压迫气管，需紧急处理。其他并发症还包括切口感染、甲状腺功能减退等，与手术范围及个体差异相关。
术后应定期复查甲状腺功能，出现声嘶持续不缓解或四肢抽搐等症状时需及时就医。保持切口清洁干燥，遵医嘱补充钙剂和甲状腺激素。
