复发性口腔溃疡首先与免疫有着很密切的关系。有的患者表现为免疫缺陷，有的患者则表现为自身免疫反应，也就是由于各种因素，使人体正常的免疫系统，对自身组织抗原，产生免疫反映，而引起组织的破坏而发病。其次是与遗传有关系，在临床中，复发性口腔溃疡的发病，有明显的家族遗传倾向，我们常常看到，父母一方或多方若患有复发性口腔溃疡，那么，他们的子女就比一般人更容易患病。
另外，复发性口腔溃疡的发作，常常还与一些疾病或症状有关，比如消化系统疾病胃溃疡，十二指肠溃疡，慢性或迁延性肝炎，结肠炎等，另外贫血，偏食，消化不良，腹泻，发热，睡眠不足，过度疲劳，精神紧张，工作压力大、月经周期的改变等等。随着一种或多种因素的活跃、交替、重叠就出现机体免疫力下降，免疫功能紊乱，也就造成了复发性口腔溃疡的频繁发作。另外还跟自身精神情趣有关，特别是阴虚体质者成为该症状的专利。
做完胃肠镜不一定需要做病理检查，是否需要进行病理检查需根据胃肠镜检查时的具体情况决定。
镜检查时若发现可疑病变如息肉、溃疡、黏膜异常改变等，通常需要取活检进行病理检查以明确病变性质。病理检查能帮助鉴别炎症、良性肿瘤、恶性肿瘤等不同情况，为后续治疗提供依据。胃肠镜检查未发现明显病变或仅为轻微炎症时，可能无须进行病理检查。部分特殊情况下如长期胃肠不适但内镜表现正常者，医生也可能建议病理检查以排除显微镜下病变。
胃肠镜检查后是否取活检由操作医生根据实时观察判断，常见需病理检查的情况包括直径超过5毫米的息肉、边界不清的溃疡、黏膜粗糙或色泽改变区域。早期胃癌、食管癌等疾病在胃肠镜下可能仅表现为细微黏膜变化，病理检查是确诊的关键。炎症性肠病患者的黏膜活检有助于判断疾病活动度和类型。部分遗传性息肉病综合征患者即使未见明显息肉也可能需要随机活检。
胃肠镜检查后应遵医嘱等待病理结果，避免剧烈运动或进食刺激性食物。保持清淡易消化饮食，适量补充优质蛋白和维生素有助于黏膜修复。若出现持续腹痛、便血等症状应及时就医复查。病理检查结果异常时应配合医生进行超声内镜、CT等进一步检查，必要时接受药物或手术治疗。定期复查胃肠镜对消化道疾病高危人群尤为重要。
